Інфопакет

ДВС.1.01.01 3 Біоінформатика

ДВС.1.01.01

Вибіркова дисципліна для ОП

Другий

2023/2024

3 Семестр

4

Здатність будувати адекватні моделі хімічних явищ, досліджувати їх для отримання нових висновків та поглиблення розуміння природи, в тому числі з використанням методів молекулярного, математичного і комп’ютерного моделювання. Здатність дотримуватися етичних стандартів досліджень і професійної діяльності в галузі хімії (академічна доброчесність, ризики для людей і довкілля тощо). Здатність формулювати нові гіпотези та наукові задачі в галузі хімії, вибирати належні напрями та відповідні методи для їх розв’язання, беручи до уваги наявні ресурси. Розуміння етичних стандартів досліджень і професійної діяльності в галузі хімії (наукова доброчесність)

Очна форма

1. Опанувати навчальні дисципліни «Теоретична і прикладна біоінформатика», «Структурна та функціональна геноміка» . 2. Володіти елементарними навичками комп’ютерного пошуку інформації та користування інтернет-ресурсами.

Предметом навчальної дисципліни є методи аналізу первинної та просторої структури білків, які використовуються для того, щоб визначати особливості та функціональну роль білків в організмі. В курсі робиться огляд основних сучасних методів молекулярної біології для лабораторного та камерального опрацювання біологічного матеріалу з метою встановлення родинних відносин між організмами, побудови філогенетичних дерев та молекулярної ідентифікації рослин, тварин і грибів: екстракція ДНК, ампліфікація, асемблінг нуклеотидних послідовностей, множинне вирівнювання послідовностей, побудова філогенетичних дерев та вторинної структури РНК. Розглядаються основні доступні програмні засоби та інтернет-ресурси і відпрацьовуюються навички роботи з ними.

1. Rigden, D. J., ed. From Protein Structure to Function with Bioinformatics, Springer, 2017 2. Wu C. H., Arighi C. N., Ross K. E., eds. Protein Bioinformatics: From Protein Modifications and Networks to Proteomics, Humana Press, 2017. 3. Pazos F., Chagoyen M. Practical Protein Bioinformatics, 2015. 4. Abriata L A, Peraro M D. State-of-the-art web services for de novo protein structure prediction/ Briefings in Bioinformatics, Volume 22, Issue 3, May 2021, bbaa139, https://doi.org/10.1093/bib/bbaa139

лекції, практичні

- семестрове оцінювання: 1. Самостійна семестрова робота: РН 2.1. - 48 балів/32 бали. 2. Доповідь під час лекції: РН 1.4,3.1 - 12 балів/6 балів. - підсумкове оцінювання: іспит – 40 балів. Усього: 100 балів/60 балів.

українська