Філогенетичний аналіз у мікробіології

Освітня програма: БІОЛОГІЯ (бакалавр) ДЕННА

Структурний підрозділ: Навчально-науковий центр “Інститут біології та медицини”

Назва дисципліни
Філогенетичний аналіз у мікробіології
Код дисципліни
Тип модуля
Вибіркова дисципліна для ОП
Цикл вищої освіти
Перший
Рік навчання
2021/2022
Семестр / Триместр
7 Семестр
Кількість кредитів ЕСТS
3
Результати навчання
ПР01. Демонструвати спілкування в діалоговому режимі з колегами та цільовою аудиторією, ведення професійної наукової дискусії, письмово відображувати та презентувати результати своїх досліджень українською мовою. ПР02. Виявляти можливість спілкування іноземною мовою в діалоговому режимі з колегами та цільовою аудиторією. ПР03. Використовувати теорії і закони математики, фізики, хімії та інших наук для вирішення завдань сучасної біології. ПР04. Розуміти основні терміни, концепції, принципи, теорії і закони в галузі біологічних наук і на межі предметних галузей. ПР07. Демонструвати знання про структурну організацію біологічних систем на молекулярному рівні організації. ПР08. Демонструвати знання фундаментальних біологічних процесів, будови та функцій живих організмів.
Форма навчання
Очна форма
Попередні умови та додаткові вимоги
1. Знати: основи загальної мікробіології, біохімії, біофізики, генетики, молекулярної біології. 2. Вміти самостійно застосовувати знання з загальної мікробіології, біохімії, біофізики, генетики, молекулярної біології. 3. Володіти елементарними навичками опрацювання наукової літератури, вирішення задач, роботи з матеріалами та обладнанням, що використовуються в мікробіологічній лабораторії, користування ПО.
Зміст навчальної дисципліни
Предметом вивчення навчальної дисципліни є філогенетичні взаємозв’язки між мікроорганізмами, їх взаємозв’язки з іншими філами дерева життя; методи та технології отримання, порівняння, аналізу, анотації послідовностей генів та білків; методи реконструкції філогенії на основі окремих послідовностей та цілих геномів; молекулярні маркери для встановлення філогенії бактерій; горизонтальний переніс генів як фактор видового різноманіття мікроорганізмів; сучасні підходи до аналізу геномів та реконструкції філогенії, характерні для ери «пост-омік».
Рекомендована та необхідна література
1. C. Bleidorn Phylogenomics. An Introduction. Springer International Publishing AG. 2017. 222 p. 2. Palsson B.O. Systems Biology. Constraint-based Reconstruction and Analysis. Cambridge University Press. - 2015. - 531 p. 3. Сиволоб, А. В. Молекулярна біологія. — К. : Видавничо-поліграфічний центр «Київський університет», 2008, 384 с. 4. Генетика / А. В. Сиволоб, С. Р. Рушковський, С. С. Кир'яченко та ін. ; за ред. А. В. Сиволоба, — К. : Видавничо-поліграфічний центр «Київський університет», 2008, 320 с.
Заплановані освітні заходи та методи викладання
Лекція Самостійна робота
Методи та критерії оцінювання
Семестрове оцінювання: 1. Модульна контрольна робота з 1-го розділу: РН 1.1, 1.2, 1.3, 2.1, 2.2, 3.1 – 30 балів/15 балів 2. Модульна контрольна робота з 2-го розділу РН 1.4, 1.5, 2.3, 2.4, 3.1 – 24/12 балів 3. Модульна контрольна робота з 3-го розділу РН 1.4, 1.5, 2.3, 2.4, 3.1 – 20 балів/10 балів 4. Поточна перевірка знань (короткі контрольні роботи, 10 робіт по 1,6 балів) РН 1.1-3.1 – 16 балів/8 балів 5. Доповідь: РН 3.1 – 10 балів/5 балів - підсумкове оцінювання: у формі заліку
Мова викладання
Українська

Кафедри

Наступні кафедри задіяні у викладанні наведеної дисципліни

Кафедра Мікробіології та імунології
Навчально-науковий центр “Інститут біології та медицини”