Біоінформатика
Освітня програма: БІОЛОГІЯ (магістр) ЗАОЧНА
Структурний підрозділ: Навчально-науковий центр “Інститут біології та медицини”
Назва дисципліни
Біоінформатика
Код дисципліни
Тип модуля
Обов’язкова дисципліна для ОП
Цикл вищої освіти
Другий
Рік навчання
2021/2022
Семестр / Триместр
1 Семестр
Кількість кредитів ЕСТS
3
Результати навчання
ПР2. Використовувати бібліотеки, інформаційні бази даних, інтернет р есурси для пошуку необхідної інформації.
ПР10. Представляти результати наукової роботи письм ово (у вигляді звіту, наукових публікацій тощо) та усно (у формі
доповідей та захисту звіту) з використанням сучасних технологій, аргументувати свою позицію в науковій дискусії.
ПР11. Проводити статистичну обробку, аналіз та узагальнення отриманих експериментальних даних із використанням програмних засобів та сучасних інформаційних технологій.
ПР14. Дотримуватись норм академічної доброчесності під час навчання та провадження наукової діяльності, знати основні правові норми щодо захисту інтелектуальної власності.
ПР15.Уміти самостійно планувати і виконувати інноваційне завдання та формулювати висновки за його результатами.
ПР19. Вирішувати науково-теоретичні, науково-дослідні та прикладні задачі біології відповідними методами.
Форма навчання
Заочна форма
Попередні умови та додаткові вимоги
1.Успішне опанування курсів "Фізика", "Біохімія", "Молекулярна біологія", "Біофізика".
2.Знати: математичний аналіз, інформатику, молекулярну біологію, генетикута біофізику.
3. Вміння самостійно застосовувати знання з біофізики та ін. дисциплін, використовувати комп'ютер , працювати з науковою
літературою.
Зміст навчальної дисципліни
Курс присвячено принципам біоінформатичного аналізу та ознайомленню з наявним інструментарієм для його проведення. Розглядаються основні бази даних біологічної інформації та інструменти для біоінформатичного аналізу. Висвітлюються підходи до пошуку, гомологічного вирівнювання та аналізу нуклеотидних і амінокислотних послідовностей, принципи філогенетичного аналізу, принципи передбачення просторових структур білків та РНК; принципи моделювання молекулярної динаміки
.
Рекомендована та необхідна література
1. Michael Sundstrom, Martin Norin Stru ctural Genomics and High Throughput Structural Biology. - 2005, P. 304.
2. Оглобля О.В., Мірошниченко М.С., Костерін С.О. Комп’ютерне моделювання в біології, – Київ: Азбука, 2012, 120 с.
3. А.В. Сиволоб Молекулярна біологія.-К.: Видавничо-поліграфічний центр «Київський університет», 2008, 384 с.
4. Martin Karplus Guide to Biomolecular Simulations (Focus on Structural Biology). -2005, P. 224.
5.Xiong J. Essential bioinformatics. – Cambridge, UK: Cambridge University Press, 2006.
6.Pevsner J. Bioinformatics and Functional Genomics. – Wiley - Blackwell , 2009. Режим доступу:http://www.bioinfbook.org.
Заплановані освітні заходи та методи викладання
Лекції, практичніа робота, самостійна робота.
Методи та критерії оцінювання
-семестрове оцінювання:
1. Модульна контрольна робота 1(проводиться дистанційно): РН 1.1 – 40 балів/20 балів
2. Модульна контрольна робота 2 ( проводиться дистанційно): РН 1.2 – 40 балів/20 балів
3.Звіти по практичним та самостійним роботиам: РН 2.1, 2.2, 3.1, 4.1– 20 балів/10 балів -
-підсумкове оцінювання: у формі заліку
Мова викладання
Українською
Викладачі
Ця дисципліна викладаеться наступними викладачами
Олександр
Володимирович
Оглобля
Кафедра Біофізики та медичної інформатики
Навчально-науковий центр “Інститут біології та медицини”
Навчально-науковий центр “Інститут біології та медицини”
Кафедри
Наступні кафедри задіяні у викладанні наведеної дисципліни
Кафедра Біофізики та медичної інформатики
Навчально-науковий центр “Інститут біології та медицини”