Молекулярне моделювання та дизайн фармакологічних препаратів

Освітня програма: БІОЛОГІЯ (магістр) ДЕННА

Структурний підрозділ: Навчально-науковий центр “Інститут біології та медицини”

Назва дисципліни
Молекулярне моделювання та дизайн фармакологічних препаратів
Код дисципліни
Тип модуля
Вибіркова дисципліна для ОП
Цикл вищої освіти
Другий
Рік навчання
2021/2022
Семестр / Триместр
2 Семестр
Кількість кредитів ЕСТS
4
Результати навчання
ПР2. Використовувати бібліотеки, інформаційні бази даних, інтернет ресурси для пошуку необхідної інформації. ПР4. Розв’язувати складні задачі в галузі біології, генерувати та оцінювати ідеї. ПР14. Дотримуватись норм академічної доброчесності під час навчання та провадження наукової діяльності, знати основні правові норми щодо захисту інтелектуальної власності. ПР18. Моделювати об’єкти і процеси у живих організмах та їхніх компонентах із використанням математичних методів й інформаційних технологій. ПР19. Вирішувати науково-теоретичні, науково-дослідні та прикладні задачі біології відповідними методами. ПР23. Застосовувати сучасні фізичні і фізико-хімічні методи в біологічних дослідженнях, а також методи роботи з сучасними інформаційно-комунікаційними системами.
Форма навчання
Очна форма
Попередні умови та додаткові вимоги
1. Успішне опанування курсів з вищої математики, загальної фізики та хімії, «Основи інформаційних технологій», “Біофізика”, “Радіобіологія”, "Молекулярна біологія", “Біохімія”, “Біотехнологія” бакалаврського рівня освіти. 2. Вміти самостійно застосовувати знання з математики, хімії та фізики, біофізики, радіобіології та молекулярної біології, біохімії та біотехнології, використовувати комп'ютер, працювати з науково-методичною літературою.
Зміст навчальної дисципліни
"Молекулярне моделювання та дизайн фармакологічних препаратів" – це інтегральна наука, що виникла на стику хімічних, фізичних, біологічних та медичних наук. Її завданням є використання комплексу фундаментальних знань та комп’ютерних технологій, спрямованих на створення нових фармакологічних препаратів, що володіють специфічною біологічною активністю. «Молекулярне моделювання та дизайн фармакологічних препаратів» – одна з тих важливих дисциплін, що наразі визначає науково-технічний прогрес. З її стрімким розвитком пов'язано вирішення глобальної проблеми людства – поліпшення стану охорони здоров'я.
Рекомендована та необхідна література
1. Medicinal Chemistry: A molecular and Biochemical approach. Third Edition by Thomas Nogrady and Donald F. Weaver. Oxford University Press, New York. 2005, 649 pp. 2. Структурні бази даних біооб’єктів: 3D: PDB (www.rcsb.org/pdb/home/home.do) та 2D:http://its2.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/; http://www.uniprot.org/). 3. Хімічні бази даних: ChemAxon. 4. Розрахункові пакети програм: MD: Amber Tools, Gromacs, NAMD - Scalable Molecular Dynamics (www.ks.uiuc.edu/Research/namd/) та MDock: AutoDock (http://autodock.scripps.edu/), Dock, Flo+, https://en.wikipedia.org/wiki/Docking_(molecular). 5. Програмне забезпечення: MATLAB, Mathematics, Simulink, COMSOL Multiphysics та Maestro Schrödinger (https://www.schrodinger.com/maestro).
Заплановані освітні заходи та методи викладання
Лекція, лабораторна робота, самостійна робота
Методи та критерії оцінювання
Семестрове оцінювання: 1. Модульна контрольна робота 1 – РН 1.1; 1.2. – 30 балів/ 15 балів 2. Модульна контрольна робота 2 – РН 1.3; 1.4 – 30 балів/ 15 балів 3. Звіти по лабораторних роботах – РН 2.1-2.3; 3.1 – 30 балів/ 15 балів 4. Проміжне тестування – РН1.1-1.4; 4.1 – 10 балів/ 5 балів Підсумкове оцінювання: у формі заліку
Мова викладання
Українська

Кафедри

Наступні кафедри задіяні у викладанні наведеної дисципліни

Кафедра Біофізики та медичної інформатики
Навчально-науковий центр “Інститут біології та медицини”