Інфопакет

Принципи молекулярного моделювання

Вибіркова дисципліна для ОП

Перший

2021/2022

6 Семестр

3

ПР03. Використовувати теорії і закони математики, фізики, хімії та інших наук для вирішення завдань сучасної біології. ПР04. Розуміти основні терміни, концепції, принципи, теорії і закони в галузі біологічних наук і на межі предметних галузей. ПР05. Використовувати знання і демонструвати дотримання положень біологічної етики, біологічної безпеки і біологічного захисту. ПР07. Демонструвати знання про структурну організацію біологічних систем на молекулярному рівні організації. ПР15. Застосовувати у професійній діяльності методи визначення структурних та функціональних характеристик біологічних систем на різних рівнях організації. ПР17. Шляхом самостійного навчання освоїти нові знання та сучасні методи експериментальних досліджень для вирішення проблемних завдань біології. ПР21. Вирішувати прикладні задачі біології відповідні методи. ПР23.1. Володіти (сучасними) базовими біофізичними методами в біологічних дослідженнях.

Очна форма

1. Успішне опанування курсів "Фізика", "Молекулярна біологія", «Сучасні інформаційні технології». 2. Знати: теоретичні і практичні основи застосування фізичних методів у біологічних та медичних дослідженнях, загальний курс фізики та математичного аналізу; 3. Володіти: навичками сучасних інформаційних технологій.

Навчальна дисципліна «Принципи молекулярного моделювання» викладається у 6 семестрі студентам бакалаврам 3-го курсу, що навчаються на кафедрі біофізики та медичної інформатики. Під час вивчення курсу значна увага приділяється формуванню у студентів уявлення про принципи та підходи до виконання моделювання біофізичних властивостей різноманітних молекулярних систем. Предмет навчальної дисципліни «Принципи молекулярного моделювання» охоплює вивчення системних підходів до розуміння та вивчення принципів роботи програмного забезпечення та шляхи виконання біофізичного аналізу молекулярних систем за допомоги комп’ютеру. У ході вивчення дисципліни значна увага приділяється практичному застосуванню таких підходів для вирішення конкретних розрахункових задач.

1. Prylutskyy YI, Durov SS, Ogloblya OV, Buzaneva EV, Scharff P. Molecular dynamics simulation of mechanical, vibrational and electronic properties of carbon nanotubes. Computational Materials Science. 2000. 17 (2-4).P. 352-355 2. Makarets MV, Prylutskyy YI, Ogloblya OV, Carta-Abelmann L, Scharff P. Computer simulation of supported C60 fullerenes fragmentation by particle beam. Carbon. 2004. 42 (5-6). P. 987-990. 3. Prylutsky YI, Ogloblya OV, Scharff P. Computer modelling of the optical absorption spectrum of single-walled carbon nanotube bundles. Ukr. J. Phys. 2004. 49. P. A17-A20 4. Gabriel Bidaux, Miriam Sgobba, Loic Lemonnier, Anne-Sophie Borowiec, Lucile Noyer, Srdan Jovanovic, Alexander V Zholos, Shozeb Haider. Functional and modeling studies of the transmembrane region of the TRPM8 channel. G Bidaux, M Sgobba, L Lemonnier, AS Borowiec, L Noyer, S Jovanovic. Biophysical Journal. 2015. 109 (9). P.1840-1851

Лекція, самостійна робота

Семестрове оцінювання: 1. Модульна контрольна робота 1 РН 1.1- 1.3 (Розділ 1) – 30 балів/ 15 балів 2. Модульна контрольна робота 2 РН 2.1- 2.3 (Розділ 2) – 30 балів/ 15 балів 3. Звіти по самостійній роботі РН 2.1- 3.1 - 30 балів/ 15 балів 4. Усні відповіді та доповнення РН 2.1 - 3.1 – 10 балів/5 балів - підсумкове оцінювання: у формі заліку

Українська