Інфопакет

Філогенетичний аналіз у мікробіології

Вибіркова дисципліна для ОП

Перший

2022/2023

10 Семестр

3

ПР02. Застосовувати сучасні інформаційні технології, програмні засоби та ресурси Інтернету для інформаційного забезпечення професійної діяльності. ПР10. Знати основи систематики, методи виявлення та ідентифікації неклітинних форм життя, прокаріот і еукаріот й застосовувати їх для вирішення конкретних біологічних завдань. + ПР11. Розуміти структурну організацію біологічних систем на молекулярному рівні. ПР13. Знати механізми збереження, реалізації та передачі генетичної інформації та їхнє значення в еволюційних процесах. ПР14. Аналізувати взаємодії живих організмів різних рівнів філогенетичної спорідненості між собою, особливості впливу різних чинників на живі організми та оцінювати їхню роль у біосферних процесах трансформації речовин і енергії. ПР17. Розуміти роль еволюційної ідеї органічного світу.

Заочна форма

1. Знати: основи загальної мікробіології, біохімії, біофізики, генетики, молекулярної біології. 2. Вміти самостійно застосовувати знання з загальної мікробіології, біохімії, біофізики, генетики, молекулярної біології. 3. Володіти елементарними навичками опрацювання наукової літератури, вирішення задач, роботи з матеріалами та обладнанням, що використовуються в мікробіологічній лабораторії, користування ПО.

Предметом вивчення навчальної дисципліни є філогенетичні взаємозв’язки між мікроорганізмами, їх взаємозв’язки з іншими філами дерева життя; методи та технології отримання, порівняння, аналізу, анотації послідовностей генів та білків; методи реконструкції філогенії на основі окремих послідовностей та цілих геномів; молекулярні маркери для встановлення філогенії бактерій; горизонтальний переніс генів як фактор видового різноманіття мікроорганізмів; сучасні підходи до аналізу геномів та реконструкції філогенії, характерні для ери «пост-омік».

1. C. Bleidorn Phylogenomics. An Introduction. Springer International Publishing AG. 2017. 222 p. 2. Library of Congress Cataloging-in-Publication Data 3. Pevsner, J.Bioinformatics and functional genomics / Jonathan Pevsner.—Third edition. Wiley Blackwell, Singapoure. 1124 p. 4. Palsson B.O. Systems Biology. Constraint-based Reconstruction and Analysis. Cambridge University Press. - 2015. - 531 p. 5. Сиволоб, А. В. Молекулярна біологія. — К. : Видавничо-поліграфічний центр «Київський університет», 2008, 384 с.

Лекція, самостійна робота

Семестрове оцінювання: 1. Модульна контрольна робота 1 (дистанційно): РН 1.1 - 3.1 – 30 балів/15балів 2. Модульна контрольна робота 2 (дистанційно): РН 1.1 - 3.1 – 30 балів/15балів 3. Підсумкова модульна контрольна робота: РН 1.1 – 3.1 – 30 балів/15балів 4. Реферат: РН 3.1 – 10 балів/5балів Підсумкове оцінювання: у формі заліку

українською