Інфопакет

Актуальні питання біоінформатики

ДВС.1.05

Вибіркова дисципліна для ОП

Другий

2021/2022

3 Семестр

4

ПРН01. Знати і системно застосовувати методи аналізу та моделювання прикладної області, виявлення інформаційних потреб і збору вихідних даних для проектування програмного забезпечення. ПРН07. Обґрунтовано обирати парадигми і мови програмування для вирішення прикладних завдань; застосовувати на практиці системні та спеціалізовані засоби, компонентні технології (платформи) та інтегровані середовища розробки програмного забезпечення. ПРН08. Проводити аналітичне дослідження параметрів функціонування програмних систем для їх валідації та верифікації, а також проводити аналіз обраних методів, засобів автоматизованого проектування та реалізації програмного забезпечення. ПРН14. Пояснити, аналізувати, цілеспрямовано шукати і обирати необхідні для вирішення фахових наукових і прикладних задач інформаційно-довідкові та науково-технічні ресурси і джерела знань з урахуванням сучасних досягнень науки і техніки. Посилання !!!!

Очна форма

1. Знати: основи елементарної математики, дискретної математики, алгебри, математичної логіки та теорії алгоритмів, програмування, теорії формальних систем, нейронних мереж. 2. Вміти: аналізувати автоматні мови. 3. Володіти навичками: розробки та реалізації алгоритмів на мовах програмування.

Мета дисципліни – «Актуальні питання біоінформатики» є розширення знань з формальних мов і граматик та теорії мультимножин з подальшим застосування отриманих знань в формалізації процесів, що використовуються в обчисленнях на ДНК. В результаті вивчення навчальної дисципліни студент повинен: знати основні визначення теорії формальних мов та граматик, визначення теорії мультимножин, основні концепції структурної організації нуклеїнових кислот, механізми відтворення і реалізації генетичної інформації; вміти формалізувати біологічні процеси ДНК молекули та застосовувати отримані результати для вирішення задач ДНК-обчислення.

1. DNA computing. [Електронний ресурс]: Wikipedia, the free encyclopedia. – Режим доступу: http://en.wikipedia.org/wiki/DNA_computing 2. J. Pevsner. Bioinformatics and Functional Genomics. Second Edition. Published by John Wiley & Sons, 2009. ISBN: 978-0-470-08585-1. 3. Дж. Хопкрофт, Р. Мотвани, Д. Ульман. Введение в теорию автоматов, языков и вычислений. – М.: Вильямс, 2002. – 528 с. 4. Г.Г. Малинецкий, С.А. Науменко. Вычисления на ДНК. Эксперименты. Модели. Алгоритмы. Инструментальные средства [Електронний ресурс]/ – Режим доступу: http://www.keldysh.ru/papers/2005/prep57/prep2005_57.html. 5. Мальцев А.И. Алгебраические системы. – Москва: Наука, 1970. 6. Паун Г., Розенберг Г., Саломаа А. ДНК-компьютер. Новая парадигма вычислений. Пер. с англ. – Москва: Мир, 2003. – 528 с. 7. Петровский А.Б. Основные понятия теории мультимножеств / Б. Петровский. – Москва: Едиториал УРСС, 2002. – 80 с. Посилання !!!!!

Лекції, лабораторні заняття, самостійна робота, контрольні роботи, домашні завдання, залік.

- семестрове оцінювання: Семестрове оцінювання: 1. Контрольна робота 1: РН 1.1, РН 1.2 – 20/12 балів. 2. Контрольна робота 2: РН 1.2, РН1.3 – 20/12 балів. 3. Самостійна робота 1 (проект): РН 2.1, РН3.1, РН4.1, РН4.2 – 30/18 балів. 4. Самостійна робота 2 (проект): РН 2.1, РН3.1, РН4.1, РН4.2 – 30/18 балів. - підсумкове оцінювання (у формі заліку)

Українська