Інфопакет

Філогенетичний аналіз у мікробіології

Вибіркова дисципліна для ОП

Перший

2023/2024

7 Семестр

3

ПР02. Застосовувати сучасні інформаційні технології, програмні засоби та ресурси Інтернету для інформаційного забезпечення професійної діяльності. ПР10. Знати основи систематики, методи виявлення та ідентифікації неклітинних форм життя, прокаріот і еукаріот й застосовувати їх для вирішення конкретних біологічних завдань. ПР11. Розуміти структурну організацію біологічних систем на молекулярному рівні. ПР13. Знати механізми збереження, реалізації та передачі генетичної інформації та їхнє значення в еволюційних процесах. ПР14. Аналізувати взаємодії живих організмів різних рівнів філогенетичної спорідненості між собою, особливості впливу різних чинників на живі організми та оцінювати їхню роль у біосферних процесах трансформації речовин і енергії.

Очна форма

1. Знати: основи загальної мікробіології, біохімії, біофізики, генетики, молекулярної біології. 2. Вміти самостійно застосовувати знання з загальної мікробіології, біохімії, біофізики, генетики, молекулярної біології. 3. Володіти елементарними навичками опрацювання наукової літератури, вирішення задач, роботи з матеріалами та обладнанням, що використовуються в мікробіологічній лабораторії, користування ПО.

Предметом вивчення навчальної дисципліни є філогенетичні взаємозв’язки між мікроорганізмами, їх взаємозв’язки з іншими філами дерева життя; методи та технології отримання, порівняння, аналізу, анотації послідовностей генів та білків; методи реконструкції філогенії на основі окремих послідовностей та цілих геномів; молекулярні маркери для встановлення філогенії бактерій; горизонтальний переніс генів як фактор видового різноманіття мікроорганізмів; сучасні підходи до аналізу геномів та реконструкції філогенії, характерні для ери «пост-омік».

1. C. Bleidorn Phylogenomics. An Introduction. Springer International Publishing AG. 2017. 222 p. 2. Library of Congress Cataloging-in-Publication Data 3. Pevsner, J.Bioinformatics and functional genomics / Jonathan Pevsner.—Third edition. Wiley Blackwell, Singapoure. 1124 p. 4. Palsson B.O. Systems Biology. Constraint-based Reconstruction and Analysis. Cambridge University Press. - 2015. - 531 p. 5. Сиволоб, А. В. Молекулярна біологія. — К. : Видавничо-поліграфічний центр «Київський університет», 2008, 384 с. 6. Генетика / А. В. Сиволоб, С. Р. Рушковський, С. С. Кир'яченко та ін. ; за ред. А. В. Сиволоба, — К. : Видавничо-поліграфічний центр «Київський університет», 2008, 320 с. 7. .A. Oren and R. T. Papke Molecular Phylogeny of Microorganisms. Caister Academic Press. USA,2010. 220 p. 8. Birge E. A. Bacterial and Bacteriophage Genetics Fifth Edition. –NY.: Springer, 2006. – 577 pp.

Лекція Самостійна робота

Семестрове оцінювання: 1. Модульна контрольна робота з 1-го розділу: РН 1.1, 1.2, 1.3, 2.1, 2.2, 3.1 – 30 балів/15 балів 2. Модульна контрольна робота з 2-го розділу РН 1.4, 1.5, 2.3, 2.4, 3.1 – 24/12 балів 3. Модульна контрольна робота з 3-го розділу РН 1.4, 1.5, 2.3, 2.4, 3.1 – 20 балів/10 балів 4. Поточна перевірка знань (короткі контрольні роботи, 10 робіт по 1,6 балів) РН 1.1-3.1 – 16 балів/8 балів 5. Доповідь: РН 3.1 – 10 балів/5 балів - підсумкове оцінювання: у формі заліку

Українська