Інфопакет

Квантово-механічні методи дослідження фізичних властивостей молекул

ВК 9

Вибіркова дисципліна для ОП

Другий

2023/2024

7 Семестр

4

Знати основні методи; їх можливості та обмеження застосування; основні фізичні властивості молекул: електронна, коливна структура, енергія, заряди тощо; напівемпіричні та першопринципні методи розрахунку будови та оптичних властивостей молекул; знати сучасні програмні пакети GAUSSIAN, Avogadro, HyperChem та ін.. Знати основи методу функціоналу густини та особливості його застосування до задач досліджень фізичних властивостей молекул; перелік функціоналів, що використовуються при розрахунках та критерії їх вибору. Вміти: будувати молекули, здійснювати розрахунки їх геометричної оптимізації, електронних та коливних властивостей, енергетичних характеристик та порівнювати їх з відповідними експериментальними даними.

Очна форма

Знати основи математичного аналізу, математичного моделювання, механіки, електрики та магнетизму, оптики, молекулярної фізики, термодинаміки, квантової механіки. Вміти застосовувати попередні знання з курсів математичного аналізу, диференціальних рівнянь, математичного моделювання, квантової механіки. Володіти елементарними навичками математичних перетворень, побудови алгоритмів, опису квантових систем.

Українською В рамках курсу «Квантово-механічні методи досліджень фізичних властивостей молекул» вивчаються: квантово-механічні методи розрахунку геометрії, енергії, електронних та коливних властивостей молекул та ознайомлення студентів з відповідними сучасними програмними пакетами; вивчення залежностей оптичних спектральних властивостей молекул в залежності від їх будови для їх застосувань у наукових розробках та прикладних галузях

1.Dill K.A., Ozkan S.B., Weikl T.R., Chodera J.D., Voelz V.A. (2007). The protein folding problem: when will it be solved? Curr. Opin. Struct. Biol. 17, 342–346; 2.Levinthal C. (1968). Are there pathways for protein folding. J. Chim. Phys. 65, 44–45 (pdf, 8 Кб); 3.Xu Y., Purkayastha P., Gai F. (2006). Nanosecond folding dynamics of a three-stranded beta-sheet. J. Am. Chem. Soc. 128, 15836–15842; 4.Zagrovic B., Snow C.D., Shirts M.R., Pande V.S. (2002). Simulation of folding of a small alpha-helical protein in atomistic detail using worldwide-distributed computing.J. Mol. Biol. 323, 927–937 5.Bradley P., Misura K.M.S., Baker D. (2005). Toward High-Resolution de Novo Structure Prediction for Small Proteins. Science 309, 1868–1871; 6.Zhang T., Skolnick J. (2004). Automated structure prediction of weakly homologous proteins on a genomic scale. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101, 7594–7599 ;

Лекції, самостійна робота, практичні роботи

Опитування в процесі лекції, перевірка рефератів та інших форм самостійної роботи, звіти про виконання практичних робіт, модульна контрольна контрольна робота, залік

Українська