Інфопакет

Принципи молекулярного моделювання

Вибіркова дисципліна для ОП

Перший

2022/2023

6 Семестр

3

ПР06. Застосовувати моделі, методи і дані фізики, хімії, еко- логії, математики у процесі навчання та забезпечення профе- сійної діяльності. ПР28.1. Володіти сучасними методами інформаційних технологій у біології. ПР29.1. Застосовувати отримані теоретичні знання та практичні навички для планування та проведення наукових експериментів в галузі біофізики.

Очна форма

1. Успішне опанування курсів "Фізика", "Молекулярна біологія", «Сучасні інформаційні технології». 2. Знати: теоретичні і практичні основи застосування фізичних методів у біологічних та медичних дослідженнях, загальний курс фізики та математичного аналізу; 3. Володіти: навичками сучасних інформаційних технологій.

Навчальна дисципліна «Принципи молекулярного моделювання» викладається у 6 семестрі студентам бакалаврам 3-го курсу, що навчаються на кафедрі біофізики та медичної інформатики. Під час вивчення курсу значна увага приділяється формуванню у студентів уявлення про принципи та підходи до виконання моделювання біофізичних властивостей різноманітних молекулярних систем. Предмет навчальної дисципліни «Принципи молекулярного моделювання» охоплює вивчення системних підходів до розуміння та вивчення принципів роботи програмного забезпечення та шляхи виконання біофізичного аналізу молекулярних систем за допомоги комп’ютеру. У ході вивчення дисципліни значна увага приділяється практичному застосуванню таких підходів для вирішення конкретних розрахункових задач.

1. Prylutskyy YI, Durov SS, Ogloblya OV, Buzaneva EV, Scharff P. Molecular dynamics simulation of mechanical, vibrational and electronic properties of carbon nanotubes. Computational Materials Science. 2000. 17 (2-4).P. 352-355 2. Makarets MV, Prylutskyy YI, Ogloblya OV, Carta-Abelmann L, Scharff P. Computer simulation of supported C60 fullerenes fragmentation by particle beam. Carbon. 2004. 42 (5-6). P. 987-990. 3. Prylutsky YI, Ogloblya OV, Scharff P. Computer modelling of the optical absorption spectrum of single-walled carbon nanotube bundles. Ukr. J. Phys. 2004. 49. P. A17-A20 4. Gabriel Bidaux, Miriam Sgobba, Loic Lemonnier, Anne-Sophie Borowiec, Lucile Noyer, Srdan Jovanovic, Alexander V Zholos, Shozeb Haider. Functional and modeling studies of the transmembrane region of the TRPM8 channel. G Bidaux, M Sgobba, L Lemonnier, AS Borowiec, L Noyer, S Jovanovic. Biophysical Journal. 2015. 109 (9). P.1840-1851

Лекція, самостійна робота

Семестрове оцінювання: 1. Модульна контрольна робота 1 РН 1.1- 1.3 (Розділ 1) – 30 балів/ 15 балів 2. Модульна контрольна робота 2 РН 2.1- 2.3 (Розділ 2) – 30 балів/ 15 балів 3. Звіти по самостійній роботі РН 2.1- 3.1 - 30 балів/ 15 балів 4. Усні відповіді та доповнення РН 2.1 - 3.1 – 10 балів/5 балів - підсумкове оцінювання: у формі заліку

Українська